自叙序卷一总论部痈疽之脉痈疽之源痈疽之别痈疽生死法察形色顺逆法内消内托法虚实症治法经络大略十二经补泻药品针砭灸烙烘照蒸拔等法针砭灸烙卷一论症治次第虚实顺逆标本论治药忌辨症论溃疡论脓血论疮口生肌验膜症变
自叙后序卷一甘草白术人参大枣胶饴粳米薏苡小麦大麦神曲吴茱萸蜀椒干姜生姜半夏代赭石厚朴枳实栀子香豉瓜蒂蜀漆黎芦升麻葛根赤石脂禹余粮鸡子黄麻仁白蜜大黄巴豆卷二当归阿胶地黄芍药防风柴胡黄芩黄柏白头翁秦皮白蔹
叙卷之一调经总论经候卷之二血崩带下淋浊卷之三妊娠临蓐卷之四产后
保养生胎论妇人劳伤偏郁忧思食积论男女尺脉盛弱妇人受胎妇人经水不调血虚白带崩漏安胎
六因条辨卷上春温辩论春温条辨三十条论伤暑中暑中热辨误伤暑条辨二十六条中暑条辨十一条中热条辨八条六因条辨卷中伏暑辨论伏暑条辨二十八条秋燥辨论秋燥条辨十一条冬温温毒条论冬温条辨十条温毒条辨四条六因条辨卷下
原序本草从新凡例药性总义卷一草部山草类人参珠儿参党参土人参西洋人参北沙参空沙参甘草黄精萎蕤黄野白术种白术苍术桔梗天麻秦艽柴胡前胡独活羌活防风升麻细辛远志金毛狗脊淫羊藿巴戟天琐阳肉苁蓉白芨三七地榆丹参元
《汤液本草》序一《汤液本草》序二《汤液本草》后序卷之一五脏苦欲补泻药味脏腑泻火药东垣先生药类法象用药法象药性要旨气味浓薄寒热阴阳升降图（缺）升降者天地之气交用药升降浮沉补泻法五味所用药类法象标本阴阳论
序凡例上品丹砂云母石钟乳矾石朴硝滑石禹余粮紫石英五石脂扁青菖蒲菊花甘草干地黄术菟丝子牛膝柴胡麦门冬车前子木香薏苡仁泽泻龙胆细辛石斛蓍实黄连黄肉苁蓉防风续断决明子丹参五味子蛇床子沙参菌桂松脂槐实柏实茯苓
提要序一序二叙自叙卷上田展初内治效颜凤尧内治效笪豫川治效筿村侄治效兼及诸小溲不通治效牙痛治效龚玉屏治效并后不治之验龚玉屏子椿官治效并后不治之验蔡姓时医治效包式斋治效厉登铭疯症治效陈外甥疯症治效吴预生疯
叙一叙二卷一脉法辨男女脉法调经经闭崩漏赤白带安胎漏胎胎痛恶阻胎肿子烦子痫子悬子淋胎死上喘难产横生胎衣不下产后寒热产后血晕产后中风宿血肿胀产后腹痛半产阴户脱恶血入心恶血入脾恶血入肺恶血入肝卷二胎前恶阻胎